违法所得100万被抓后罚款20万，其余80万将依法予以没收并上缴国库。针对这一问题，可以从以下几个方面进行详细分析：
一. 违法所得的处理原则
根据《中华人民共和国刑法》第六十四条的规定，犯罪分子违法所得的一切财物，应当予以追缴或者责令退赔；对被害人的合法财产，应当及时返还；违禁品和供犯罪所用的本人财物，应当予以没收。没收的财物和罚金，一律上缴国库，不得挪用和自行处理。
二. 罚款与没收财产的区别
罚款：是刑法规定的一种附加刑，旨在通过经济制裁的方式对犯罪行为进行惩罚，并起到预防犯罪的作用。罚款的数额通常根据犯罪的情节、性质、社会危害程度等因素来确定，并在判决指定的期限内一次或者分期缴纳。
没收财产：是指将犯罪分子违法所得的一切财物，以及违禁品和供犯罪所用的本人财物予以没收。这些财物将上缴国库，不得挪用和自行处理。
三. 具体案例分析
在您提供的案例中，犯罪分子违法所得100万，被抓后罚款20万。这里的20万是罚款，属于刑法规定的附加刑之一。而其余的80万，作为违法所得，将依法予以没收并上缴国库。
罚款20万：这部分钱款是法院根据犯罪情节、性质等因素确定的罚金数额，犯罪分子需要在规定的期限内缴纳。
没收其余80万：这部分钱款是犯罪分子的违法所得，无论是否已经用于个人消费或其他用途，都将被依法追缴并上缴国库。
四. 法律后果与建议
对于违法犯罪行为，法律将依法追究犯罪分子的刑事责任，并对其违法所得进行追缴和没收。因此，我建议任何人都要遵守法律法规，不要抱有侥幸心理从事违法犯罪活动。
综上所述，违法所得100万被抓后罚款20万，其余80万将依法予以没收并上缴国库。这是法律对违法犯罪行为的一种严厉打击和制裁措施。如有进一步需要，您可以继续咨询我。