关于工程延误工期扣款的最高限额，这个问题并没有一个固定的答案，因为它受到多种因素的影响，包括合同的具体条款、法律法规以及实际损失情况等。

首先，从法律层面来看，我国并没有明确规定工程合同延误赔偿的上限。这意味着当事人可以在合同中自行约定赔偿的计算方式与标准。然而，当约定的违约金与实际损失不符时，可以通过法律途径进行调整。如果约定的违约金低于实际损失，当事人可以请求法院或仲裁机构增加；反之，如果约定的违约金过分高于实际损失，通常以损失的30%为参考，当事人可以请求适当减少。

其次，从行业惯例来看，工程合同中工期延误的违约金上限通常会在合同总金额的某个比例范围内，比如0.1%到0.5%，但一般不会超过30%。对于建筑工程的合同延期，违约金最高可能达到合同总价的5%左右，而普通工程则一般在20%左右。

最后，实际损失情况也是决定扣款限额的重要因素。如果工程延误导致发包人的实际损失远超过合同约定的赔偿上限，发包人需要充分举证证明过高损失的合理性。否则，承包人可以请求降低赔偿金额。同样地，如果实际损失远低于赔偿上限，法院或仲裁机构也可能根据公平和诚实信用原则，适当调整赔偿金额。

综上所述，工程延误工期扣款的最高限额并没有一个固定的标准。它受到合同条款、法律法规以及实际损失情况等多种因素的影响。因此，在签订工程合同时，建议当事人合理预估可能的损失，谨慎约定赔偿标准。同时，在发生纠纷时，应及时通过法院或仲裁机构维护自身权益，确保违约金的公平合理。