关于综合工时制员工加班费结算的问题，以下是我根据相关法律法规和常见实践给出的详细解答：

结论前置

综合工时制员工的加班费结算主要依据实际工作时间与法定标准工作时间的对比，以及是否在法定节假日工作来确定。具体计算规则如下：

1. 法定节假日加班：按不低于劳动者本人日或小时工资的300%支付加班工资。
2. 延长工作时间加班（即实际工作时间超过法定标准工作时间）：按不低于劳动者本人小时工资的150%支付加班工资。

详细解答

一、法定节假日加班

• 计算规则：无论综合计算周期内的总工作时间是否超标，只要员工在法定节假日工作，都应按照不低于其日或小时工资标准的300%支付加班费。
• 示例：假设员工月工资为3000元，法定节假日加班8小时，则加班费计算为：3000元 ÷ 21.75天 ÷ 8小时 × 300% × 8小时 = 413.79元。

二、延长工作时间加班

• 计算规则：在综合计算周期内，若员工的实际工作时间总数超过该周期的法定标准工作时间（即通常的166.64小时或根据具体周期调整），超出部分应视为延长工作时间，需按照不低于其小时工资标准的150%支付加班费。
• 示例：假设员工月工资为3000元，某月实际工作200小时，超出标准工时33小时，则延长工作时间的加班费计算为：3000元 ÷ 21.75天 ÷ 8小时 × 150% × 33小时 = 913.79元。

三、注意事项

1. 综合计算周期：综合工时制的计算周期需以劳动保障部门审批的为准，可能是周、月、季、年等。
2. 补休安排：在可能的情况下，企业应优先安排补休以减少加班费的支出。
3. 地区差异：不同地区对于综合工时制的具体规定和操作可能存在差异，需参照当地法律法规执行。

总结

综合工时制员工的加班费结算需根据具体的工作时间和安排来确定，并应严格遵守相关法律法规的规定。企业在实施时应确保合规操作，保障员工的合法权益。如有任何疑问或需要进一步的法律咨询，请直接向我提问。