医疗机构违规收费审计后可以处罚。

一. 法规依据

1. 根据《云南省非营利性医疗服务价格》中的规定：“病人住院天数按计入不计出的办法计算”，这是关于医疗服务收费的具体规定。
2. 审计机构在对医疗机构进行财务收支审计时，若发现医疗机构违反了相关收费规定，如多收出院当天的床位、护理和诊查费用，即构成违规收费。

二. 处罚措施

1. 违规资金收缴：审计发现违规收费后，相关部门（如县医疗保障局）会对违规资金进行收缴，并可能将其划入医疗保险账户。
2. 行政约谈：除了经济处罚，相关部门还会对违规的医疗机构负责人进行约谈，以示警戒，并督促其整改。

三. 实际案例

• 以龙陵县人民政府的审计案例为例，龙陵县审计局对4个乡镇卫生院进行财务收支审计时，发现它们多收了出院当天的床位、护理和诊查费用共计52.07万元。这一行为违反了《云南省非营利性医疗服务价格》的规定，因此审计结果移送县医疗保障局处理。最终，这4个乡镇卫生院不仅被收缴了违规资金，而且它们的院长还被约谈。

综上所述，医疗机构若违规收费，在审计发现后是可以受到相应处罚的，包括违规资金的收缴和对负责人的行政约谈。我建议医疗机构应严格遵守相关收费规定，确保收费的合法性和合规性，以避免不必要的法律风险和经济损失。如有进一步需要，您可以继续咨询我。