套取工程款违反了《财政违法行为处罚处分条例》中的多条纪律。具体分析如下：

一. 违反《财政违法行为处罚处分条例》第六条

• 该条例第六条规定，国家机关及其工作人员有以虚报、冒领等手段骗取财政资金的行为，将受到相应的处分。套取工程款，显然是通过虚构事实或隐瞒真相的方式骗取公共资金，符合该条款的违纪行为。

二. 违反《财政违法行为处罚处分条例》第九条

• 第九条进一步规定，单位和个人有以虚报、冒领、关联交易等手段骗取国家建设资金的行为，也将受到严厉处罚。在工程建设领域，套取工程款正是通过此类手段骗取国家建设资金，因此也违反了这一条款。

• 例如，某施工单位通过虚构工程量或虚报材料费用等方式，套取工程款用于非工程相关的支出或个人消费，即构成了对《财政违法行为处罚处分条例》第六条和第九条的违反。

综上所述，套取工程款不仅违反了党纪政纪，还明确违反了《财政违法行为处罚处分条例》的第六条和第九条。这种行为严重损害了公共利益和国家财产安全，必须依法予以严惩。我建议相关单位和个人严格遵守相关法律法规，确保工程款的合法使用，避免触碰法律红线。如有进一步需要，您可以继续咨询我。