针对你提出的“非婚生子男方失踪怎么做亲子鉴定”的问题，这里有几个建议和方向，希望能帮到你。

1. 寻找男方的替代样本：

   • 如果男方已经失踪，但之前留下过一些生物样本（如头发、指甲、牙刷上的残留物等），这些都可以作为亲子鉴定的样本。你可以联系专业的亲子鉴定机构，咨询他们是否可以使用这些替代样本进行鉴定。

2. 通过法律途径寻找男方：

   • 尽管男方失踪，但你可以尝试通过法律途径（如报警、寻人启事、法院公告等）来寻找他的下落。一旦找到他，就可以直接与他进行亲子鉴定。

3. 利用男方的近亲属样本：

   • 如果男方的近亲属（如父母、兄弟姐妹）还在，且同意参与亲子鉴定，那么他们的样本也可以在一定程度上作为参考。虽然这种方法的准确性可能稍低，但在某些情况下仍然具有参考价值。

4. 咨询专业机构：

   • 建议你咨询专业的亲子鉴定机构或遗传学专家，他们可以根据你的具体情况提供更详细、更专业的建议。这些机构通常有丰富的经验和专业的技术，能够为你提供更准确的鉴定结果。

5. 考虑法律后果：

   • 在进行亲子鉴定之前，建议你先了解相关的法律后果。例如，如果鉴定结果确认亲子关系，你可能需要考虑孩子的抚养权、继承权等问题。这些问题可能涉及到复杂的法律程序，因此建议你提前咨询律师，做好充分的准备。

综上所述，虽然男方失踪给亲子鉴定带来了一定的困难，但仍有多种方法可以尝试。建议你根据自己的具体情况，选择最适合的方法，并咨询专业人士的意见。如果有任何法律问题或需要进一步的帮助，请随时向我咨询。