女儿的父亲有案底但已去世，一般不会影响女儿的女儿（即外孙女）。具体分析如下：
在我国，政审等环节通常会对个人的家庭成员进行一定的审查，但这主要关注的是直系亲属（如父母、子女）以及部分旁系亲属的犯罪记录情况。对于已经去世的家庭成员，其犯罪记录虽然可能存在，但通常不会对外孙女的政审、就业、教育等方面产生直接影响。
政审角度：政审中，对家庭成员的审查主要是为了了解个人的家庭背景和社会关系，以评估其是否适合从事某些特定的工作或担任某些特定的职务。虽然父亲有案底，但他已经去世，与外孙女当前的政审关系不大。除非特定岗位有极其严格的政审要求，且明确规定了需要对已故家庭成员进行审查，否则一般不会影响外孙女的政审结果。
社会影响角度：从社会影响的角度来看，父亲去世后的案底也不会对外孙女产生直接的负面影响。外孙女作为独立的个体，她的品行、能力、表现等才是决定她未来发展的重要因素。
法律层面：从法律层面来说，并没有明确的法律规定父亲去世后的案底会影响其外孙女的权益或发展。法律讲究的是公平、公正，不会因为一个人的家庭成员有过犯罪记录就对其后代进行不公平的对待。
综上所述，女儿的父亲有案底但已去世，一般不会影响女儿的女儿（外孙女）的政审、就业、教育等方面。当然，如果外孙女未来计划报考某些特定岗位或从事某些特定工作，且这些岗位或工作对家庭成员的犯罪记录有严格要求，那么她可能需要提前了解并准备相应的材料或证明。但总体来说，这种情况下的影响是有限的。