小区的违建主要由城市管理行政执法局或城市管理综合行政执法局（简称城管局、城管）负责管理。具体分析如下：

一. 管理部门的确定

• 违建属于城市管理中的综合行政执法范畴，因此由城市管理行政执法局或城市管理综合行政执法局负责管理。这些部门在中国内地城市中负责综合行政执法工作，包括处理违法建筑等问题。

二. 法律依据

• 根据《中华人民共和国土地管理法》第七十四条，对于非法转让土地并在其上新建建筑物和其他设施的行为，由县级以上人民政府自然资源主管部门进行处罚。虽然这条法律主要关注的是土地非法转让，但也间接涉及了违法建筑的处理，因为违法建筑往往与非法用地相关。
• 此外，虽然《中华人民共和国城乡规划法》第六十四条直接规定了未取得建设工程规划许可证或未按照规划进行建设的处罚措施，但该法并未直接指明由哪个部门具体执行，而在实际操作中，这类违法建筑的处理通常由城管部门负责。

三. 处理流程

• 城管部门在接到违建举报后，会进行调查核实，并根据情况采取相应的处理措施，包括责令停止建设、限期改正、限期拆除等。
• 如果业主拒不配合，城管部门有权采取强制拆除等措施，并可能依法给予行政处罚或刑事处罚。

综上所述，小区的违建主要由城市管理行政执法局或城市管理综合行政执法局负责管理。如果您发现小区内有违建行为，可以向当地城管部门进行举报。