当工商部门查到侵权商品时，他们会依据相关法律法规进行一系列的处理流程，旨在维护市场秩序、保护知识产权和消费者权益。以下是详细的处罚流程及相关措施：

一、线索来源与立案

工商部门会通过多种途径发现侵权线索，如消费者投诉举报、上级部门交办、市场日常检查以及其他行政机关移送等。收到线索后，他们会进行初步核查，若认为存在涉嫌侵权事实且属于本部门管辖范围，将予以立案并启动正式调查程序。

二、调查取证

在立案后，工商部门会进行详细的调查取证工作，包括：

• 现场检查：对涉嫌侵权商品的生产、销售场所进行现场检查，查看相关物品及资料。
• 询问当事人：对生产者、销售者等相关人员进行询问，了解侵权行为的详细情况。
• 抽样取证：对涉嫌侵权商品进行抽样，并送检测机构进行鉴定。
• 查封、扣押：若有充分证据证明商品侵权，工商部门有权采取查封或扣押措施，防止侵权商品继续流通。

三、认定侵权

根据调查取证所得的证据，工商部门会依据相关法律法规来认定商品是否构成侵权。对于简单明显的侵权行为，他们可直接认定；对于复杂案件，则可能需要组织专家论证或参考鉴定意见。

四、处理决定

一旦认定侵权成立，工商部门会作出以下处理决定：

• 责令停止侵权行为：要求侵权人立即停止侵权行为，包括停止生产、销售侵权商品及销毁侵权标识。
• 没收、销毁侵权商品及工具：没收并销毁侵权商品以及用于制造侵权商品的工具，确保侵权商品不再流入市场。
• 罚款：根据侵权情节的轻重，对侵权人处以罚款。具体罚款数额通常根据侵权商品的货值金额确定，并遵循相关法律法规的规定。例如，对侵犯注册商标专用权的行为，罚款数额为非法经营额3倍以下；非法经营额无法计算的，罚款数额为10万元以下。
• 调解赔偿：根据当事人的请求，工商部门可就侵权赔偿数额进行调解。若调解不成，当事人可向人民法院提起诉讼。

五、后续监管与曝光

在处理完侵权案件后，工商部门还会进行后续监管，确保侵权人按照处理决定停止侵权行为，防止复发。同时，他们可能会通过媒体曝光侵权行为，提高公众的警觉性，并加强市场监管力度。

综上所述，工商部门在查到侵权商品时，会依法依规进行处理，以维护市场秩序、保护知识产权和消费者权益。