男方起诉离婚时，共同财产并不一定会被扣除大部分。离婚时夫妻共同财产的分割是一个复杂的问题，具体分割原则如下：

1. 一般原则：在离婚时，夫妻共同财产通常会平均分割，即男方和女方各自获得一半。这是基于婚姻期间双方共同贡献和共同所有的原则。

2. 特殊情形：

   • 财产约定：如果夫妻双方有书面约定，明确各自名下的财产归各自所有，那么离婚时就按照这个约定来分割财产。
   • 补偿请求：如果一方在婚姻期间因为抚育子女、照料老人、协助另一方工作等付出了较多义务，离婚时有权向另一方请求补偿。
   • 损害赔偿：如果一方存在过错，如重婚、虐待、遗弃家庭成员等，无过错方可以请求损害赔偿。
   • 个人财产：一方的婚前财产、因受到人身损害获得的赔偿或补偿等，属于个人财产，不参与共同财产的分割。

因此，男方起诉离婚时，共同财产的分割并不是简单地扣除大部分给其中一方，而是根据上述原则进行综合考虑和判定。如果双方无法就财产分割达成一致，可以通过诉讼程序由法院进行裁决。在诉讼过程中，法院会听取双方的意见和证据，并依法作出公正的判决。

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