董事长股份被冻结，且不是由于个人欠款引起的，可能的原因有多种。以下是一些常见的情况：

1. 公司债务问题：

   • 如果公司存在未清偿的债务，债权人可能会通过法律途径申请冻结公司股份，包括董事长的股份，以确保其债权得到保障。这种情况下，虽然冻结的是董事长的股份，但实质上是与公司债务相关联的。

2. 公司涉及法律纠纷：

   • 公司可能涉及各类法律纠纷，如合同纠纷、知识产权纠纷等。在这些纠纷中，对方当事人或法院可能会采取保全措施，冻结公司或相关人员的股份，以防止资产转移或逃避法律责任。

3. 监管机构的调查或处罚：

   • 如果公司或董事长本人涉嫌违反相关法律法规，如证券欺诈、内幕交易等，监管机构可能会采取措施冻结股份，以便进行调查或作为处罚的一部分。

4. 公司股权结构变动或重组：

   • 在公司股权结构变动或重组过程中，为了保障各方利益，可能会暂时冻结部分或全部股份，包括董事长的股份。这种情况通常是为了确保股权变动的顺利进行和各方权益的平衡。

5. 其他法律原因：

   • 除了上述原因外，还可能存在其他法律原因导致董事长股份被冻结。例如，董事长可能因涉及其他法律案件（如刑事案件）而被法院采取冻结股份的强制措施。

需要注意的是，股份被冻结并不意味着董事长失去了对公司的控制权或所有权。冻结只是一种临时的法律措施，旨在保障相关方的权益。在股份被冻结期间，董事长可能无法自由转让或处置这些股份，但其他股东权益（如表决权、收益权等）可能仍然保留。

如果您或您所在的公司面临类似情况，建议尽快咨询专业律师，以便了解具体的法律后果和应对措施。