摩托车不备案颜色，公安机关交通管理部门将处以警告或者二百元以下罚款。

一. 法律依据与处罚规定

1. 《中华人民共和国道路交通安全法》相关规定：虽然该法第十五条主要规定了警车、消防车、救护车、工程救险车的标志图案喷涂及警报器、标志灯具的安装使用，但其中也隐含了机动车不得随意改变外观，包括颜色的规定。对于摩托车改色未备案的行为，可以参照该法关于机动车管理的一般原则进行处罚。
2. 处罚措施：根据公域知识中提到的类似案例，以及《中华人民共和国道路交通安全法》关于机动车管理的相关规定，摩托车不备案颜色，公安机关交通管理部门将处以警告或者二百元以下罚款。

二. 改色备案流程

• 摩托车更改颜色如果超过了整车的30%，在车辆变更之后的10日之内，应向车管所提交变更申请，填写车辆变更登记申请表，并提交相关证件。
• 车管所会对车辆进行检验，申请通过之后就可以备案并领取新的行驶证。

三. 我的观点

• 摩托车改色虽是个性化需求，但必须遵守法律法规，按时备案。否则，不仅可能面临处罚，还会影响车辆的正常使用。
• 我建议摩托车车主在改色前，先了解当地车管所的相关规定，确保改色后能够及时备案，避免不必要的麻烦。

如有进一步需要，您可以继续咨询我。