银行卡与网络犯罪案件有资金往来，首先需要由司法机关进行调查，确定资金的性质与来源，然后根据具体情况采取相应的法律措施。具体分析如下：

一. 资金性质的调查

• 如果银行卡内的资金被证实与网络犯罪活动有关，如为犯罪所得或用于犯罪活动，司法机关将依法进行扣押、冻结，并可能作为犯罪证据或用于赔偿受害人的损失。
• 如果资金是合法所得，且与网络犯罪活动无关，持卡人可以向司法机关提出申请，证明资金的合法性，申请解除冻结或扣押。

二. 法律措施

1. 冻结与扣押：根据《中华人民共和国刑法》及相关法律规定，对于涉嫌犯罪的资金，司法机关有权进行冻结或扣押，以防止资金流失或用于其他犯罪活动。
2. 追缴与退赔：如果资金被证实为犯罪所得，司法机关将依法追缴，并可能用于退赔受害人的损失或作为罚款等。
3. 法律责任：如果持卡人明知他人利用信息网络实施犯罪，仍为其提供支付结算等帮助，根据《中华人民共和国刑法》第二百八十七条之二的规定，将可能构成帮助信息网络犯罪活动罪，需要承担相应的刑事责任。

三. 建议

• 配合调查：如果银行卡与网络犯罪案件有资金往来，建议持卡人积极配合司法机关的调查，提供必要的证据和信息。
• 证明资金合法性：如果资金是合法所得，建议持卡人尽快向司法机关提出申请，证明资金的合法性，以便尽快解除冻结或扣押。
• 法律咨询：如果持卡人对此类法律问题不清楚，建议咨询专业律师，以便更好地了解自己的权利和义务。

综上所述，银行卡与网络犯罪案件有资金往来时，应首先配合司法机关的调查，然后根据资金性质和具体情况采取相应的法律措施。如有进一步需要，您可以继续咨询我。