注册公司时，法定代表人的任职文件和复印件通常需要提交给公司登记机关，即工商行政管理部门。具体分析如下：

一. 法定代表人的任职文件

1. 任职文件的准备：在注册公司过程中，需要确定公司的法定代表人，并出具相应的任职文件。这个文件通常是由公司股东会或董事会决议产生的，明确指定某人担任公司的法定代表人。
2. 提交给登记机关：根据《公司法》和相关登记注册规定，这个任职文件需要提交给公司登记机关，即工商行政管理部门，作为公司注册登记的一部分材料。

二. 任职文件的复印件

1. 复印件的准备：为了备案和存档的需要，通常还需要提供任职文件的复印件。
2. 提交与存档：这个复印件同样需要提交给公司登记机关，并会被登记机关存档，以备后续查询和监管。

三. 实际操作流程

• 在准备公司注册材料时，应确保包含法定代表人的任职文件及其复印件。
• 提交注册材料时，将这些文件一并提交给工商行政管理部门。
• 工商行政管理部门在审核注册材料时，会检查这些文件是否齐全和合规。

我建议在准备和提交注册材料时，务必仔细核对所有文件是否齐全，特别是法定代表人的任职文件和复印件，以确保注册流程的顺利进行。如有进一步需要，您可以继续咨询我。