当企业职工因重大疾病无法继续工作时，可以按照以下步骤来处理：

一、申请病假

首先，职工需要向单位提出病假申请。根据《企业职工患病或非因工负伤医疗期规定》，企业职工因患病或非因工负伤需要停止工作医疗时，单位应根据职工实际参加工作年限和在本单位工作年限，给予三个月到二十四个月的医疗期。具体医疗期时长如下：

1. 实际工作年限十年以下的，在本单位工作年限五年以下的为三个月，五年以上的为六个月。
2. 实际工作年限十年以上的，在本单位工作年限五年以下的为六个月，五年以上十年以下的为九个月，十年以上十五年以下的为十二个月，十五年以上二十年以下的为十八个月，二十年以上的为二十四个月。

二、病假期间的待遇

在病假期间，单位需按照不低于当地最低工资标准的80%向职工支付病假工资，确保职工的基本生活得到保障。

三、医疗期满后的处理

1. 恢复工作或调岗：医疗期满后，如果职工能够恢复工作，应继续履行原劳动合同。若不能从事原工作，单位可与职工协商调岗，安排适合其身体状况的工作岗位。

2. 解除劳动合同：若职工医疗期满后仍不能从事原工作，也不能从事单位另行安排的工作，单位在提前三十日以书面形式通知职工本人或者额外支付一个月工资后，可以解除劳动合同。但在解除劳动合同时，单位需按工作年限每满一年支付一个月工资的经济补偿，并支付不低于六个月工资的医疗补助费。

四、特殊情况处理

如果职工所患疾病属于职业病，且已通过工伤认定和劳动能力鉴定，那么可以要求用人单位和工伤保险基金支付工伤赔偿项目。

综上所述，当企业职工因重大疾病不能继续工作时，应首先申请病假并享受相应的病假待遇。医疗期满后，根据职工的身体状况和工作能力，单位可与职工协商恢复工作、调岗或解除劳动合同等事宜。在整个过程中，单位应遵守相关法律法规，确保职工的合法权益得到保障。