当您的车辆在斑马线上等红灯时被电动自行车撞了，您可以按照以下步骤处理：
一、立即停车并保护现场
- 确保自身安全的情况下，立即停车，不要随意移动车辆或现场物品，以免破坏事故现场。
- 如有人员受伤，应立即抢救并拨打急救电话，同时报警，让交警前来处理。
二、责任判定
- 根据《中华人民共和国道路交通安全法》第七十条，若因一方过错导致事故，该方负全责。若双方均有过错，则根据各方行为对事故的作用来分别承担责任。
- 在此情况下，由于您停在斑马线上等红灯，通常应视为遵守交通规则。而电动自行车撞上了您的车辆，可能需要根据具体情况来判断其是否违反了交通规则，如是否超速、是否未注意观察路况等。
- 交警会通过现场勘查、调取监控、询问当事人等方式来判断事故责任。
三、处理事故
轻微事故：
- 如果事故较为轻微，双方车辆损失不大，且没有人员伤亡，您可以与电动自行车车主协商解决赔偿事宜。
- 协商时，建议保持冷静，理性沟通，尽量达成双方都能接受的赔偿方案。
- 协商成功后，可以拍照留证，记录事故现场和车辆损失情况，以便后续处理。
协商不成或事故较为严重：
- 如果双方无法协商一致，或者事故较为严重，涉及人员伤亡或较大财产损失，您应及时联系交警部门，请求他们组织赔偿调解。
- 对调解结果不满的，您可以向法院提起诉讼，通过法律途径来解决赔偿问题。
四、特殊情况处理
被追尾导致：
- 如果您的车辆是因被后车（无论是机动车还是非机动车）追尾而被动地停在斑马线上，您应立即报警，并由交警进行现场勘查和处理。
- 交警会通过查看事故现场、调取监控等方式来判断事故责任。若确定是后车追尾导致您越线停车，一般后车会承担全部责任。
因避让特殊车辆：
- 如果您是为了给执行紧急任务的警车、消防车、救护车、工程救险车等特殊车辆让行，而不得已将车停在斑马线上，您可以在事后收集相关证据（如行车记录仪视频、特殊车辆执行任务的证明等）。
- 向交警部门提出申诉，经核实情况属实后，可免于对越线停车的处罚。
五、后续事宜
- 在处理完事故后，如果您的车辆需要维修，建议及时将车辆送至正规维修店进行维修。
- 如果事故涉及保险理赔，您需要按照保险公司的要求提供相关证明材料，以便进行理赔。
总之，在处理此类事故时，您需要保持冷静、理性应对，并严格遵守相关法律法规和交通规则。同时，也建议您在日常驾驶过程中加强安全意识，遵守交通规则，确保自己和他人的安全。