租车跑网约车时，车辆自然损坏一般由租车公司负责。下面我将对此进行详细分析：

一. 租车合同关系分析

1. 合同性质：租车跑网约车，首先涉及的是租车公司与租车人之间的租车合同关系。根据合同法的相关规定，双方应按照合同约定履行各自的权利和义务。
2. 损坏责任：在租车合同中，通常会明确车辆损坏的责任归属。一般情况下，对于车辆的自然损坏（即非因租车人过错或故意造成的损坏），应由租车公司承担维修或更换的责任。

二. 网约车运营特点分析

1. 运营模式：网约车运营中，车辆是租车公司提供给租车人用于运营的工具。租车人支付租金，获得车辆的使用权，但并不拥有车辆的所有权。
2. 风险分担：由于车辆的所有权和使用权分离，车辆自然损坏的风险通常不由租车人承担，而是由租车公司作为车辆的所有者来承担。

三. 法律依据

1. 《中华人民共和国合同法》：根据该法，合同双方应遵循公平原则确定各自的权利和义务。在租车合同中，租车公司作为车辆的所有者和出租方，应承担车辆自然损坏的风险。

综上所述，在租车跑网约车的情况下，车辆自然损坏一般应由租车公司负责。这是因为租车合同中通常会明确车辆损坏的责任归属，且根据合同法的相关规定，租车公司作为车辆的所有者和出租方，应承担相应的风险。如果租车公司拒绝承担责任，租车人可以依据租车合同和相关法律法规来维护自己的合法权益。如有进一步需要，您可以继续咨询我。