当法院确认房屋被偷拆的行为违法后，申请国家赔偿应遵循以下程序：

1. 明确赔偿义务机关：

   • 赔偿义务机关是实施违法强拆行为的行政机关。例如，如果是区政府组织实施的强拆，区政府就是赔偿义务机关；如果是由某个政府部门（如城管局）具体实施，则该部门为赔偿义务机关。

2. 准备并提交赔偿申请材料：

   • 基本材料：包括身份证明（个人需提供身份证复印件）、强拆违法的生效法律文书（如法院判决书）、财产损失清单及相关证据（如被拆除房屋的照片、视频、评估报告、购买发票等）。
   • 撰写赔偿申请书：明确请求事项（如要求恢复原状、支付赔偿金等），陈述事实经过及法律依据（引用《国家赔偿法》相关条款），并附证据目录及材料清单。
   • 提交方式：直接向赔偿义务机关递交书面申请，或邮寄提交（建议使用EMS并保留寄送凭证）。

3. 协商与初步处理：

   • 赔偿义务机关收到申请后，应在规定期限内（通常为两个月）进行审查。若认为申请符合条件，可与申请人协商赔偿金额和方式；若认为不符合条件，可能作出不予赔偿决定。

4. 申请复议或提起诉讼：

   • 复议程序：对赔偿义务机关的处理结果不满意时，可在收到决定之日起30日内向其上一级机关申请复议。复议机关需在60日内作出决定（特殊情况可延长）。
   • 诉讼程序：若复议后仍不服，或赔偿义务机关逾期未答复，可在期限届满之日起3个月内向人民法院提起行政赔偿诉讼。需提供起诉状、原赔偿申请材料、复议决定书（如有）等证据。

5. 参与司法程序：

   • 在行政诉讼中，法院将审理赔偿请求的合法性及合理性，可能委托专业机构对损失进行评估鉴定。双方需举证质证，法院最终根据查明的事实作出判决。

6. 执行赔偿决定：

   • 主动履行：赔偿义务机关应在判决书生效后及时支付赔偿金或采取其他补救措施。
   • 强制执行：若义务机关拒不履行，申请人可向一审法院申请强制执行，法院可采取查封、扣押财产等措施确保赔偿到位。

注意事项：

• 申请国家赔偿的期限为两年，自知道或应当知道权利受损之日起计算。
• 强拆发生时应立即报警、拍照录像，留存现场证据，并保存与房屋权属、价值相关的所有文件。

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