毕业的三方协议确实需要盖章，以下是详细解释：
一、三方协议的基本性质与目的
三方协议，也称为《全国普通高等学校毕业生就业协议书》，是由国家就业主管部门统一制定的，旨在明确毕业生、用人单位和学校三方在毕业生就业过程中的权利和义务。这份协议不仅关乎毕业生的就业安排，还涉及学校对毕业生的管理和服务，以及用人单位对毕业生的接收和安排。
二、盖章的重要性
法律效力：三方协议需要用人单位和学校相继盖章，才能具备完整的法律效力。学校作为协议的一方，其盖章代表了学校对协议内容的认可，并承诺履行相关职责，从而增加了协议的公信力和法律效力。
保障权益：学校盖章是对用人单位的一种审核和认可，有助于降低毕业生遭遇就业欺诈的风险。同时，学校可依据协议内容协助毕业生解决就业过程中的纠纷，维护毕业生的合法权益。
确认资质：对于用人单位而言，学校盖章是对毕业生身份、学历等信息的真实性和有效性的证明。这有助于用人单位放心录用毕业生，并办理相关接收手续。
办理手续：在某些情况下，学校盖章的三方协议是用人单位办理接收毕业生手续的重要依据。例如，毕业生需要持学校盖章的协议到用人单位报到，用人单位才能正式接收并办理相关手续。
三、签订流程与注意事项
初步沟通与获取协议：毕业生应与用人单位进行充分沟通，了解岗位信息，并从学校或用人单位处获取三方协议模板。
填写信息与单位审核：毕业生应如实填写个人信息，并提交给用人单位审核。用人单位在审核无误后，会在协议上加盖公章或合同专用章。
学校审核与盖章：用人单位盖章后，毕业生需将协议带回学校进行审核。学校相关部门在确认协议内容无误后，会加盖学校公章。这一步骤至关重要，建议毕业生务必完成。
留存协议：三方各执一份协议留存，以备后续需要。毕业生应妥善保管自己的协议，以便在需要时提供证明。
在签订过程中，毕业生还需注意确保用人单位印章的规范性与信息的一致性，明确协议中的关键条款，并了解并遵守地方人事主管部门的特殊规定。
四、特殊情况说明
虽然一般情况下三方协议需要学校盖章才能生效，但在某些特殊情况下，如实习性质的简单协议或双方有明确约定且不涉及学校职责的协议，可能不需要学校盖章即有效。然而，对于正规的、涉及毕业生正式就业并需要学校履行相应职责的三方协议，建议毕业生务必按照正规流程完成学校盖章。
综上所述，毕业的三方协议确实需要盖章，特别是学校的盖章。这不仅是协议生效的必要条件，也是保障毕业生权益、确认毕业生资质以及办理相关手续的重要依据。因此，建议毕业生在签订三方协议时务必注意盖章问题，并遵循正规流程完成协议签订。