初中杀人案的三位杀人犯分别被判处无期徒刑、十二年有期徒刑和不予刑事处罚。具体分析如下：

一. 判决结果

1. 主犯张某某：因策划犯罪、实施致命攻击，被判处无期徒刑，剥夺政治权利终身。张某某作为犯罪主导者，手段残忍，被认定主观恶性极深。
2. 从犯李某：因协助控制受害者，被判有期徒刑十二年。李某虽参与施暴但非策划者，根据其犯罪情节和危害程度，法院作出了相应的判决。
3. 马某某：因未参与预谋和直接施暴，仅负责望风，不予刑事处罚，由公安机关和教育部门进行专门矫治教育。马某某的行为危害性相对较小，因此未被判处刑罚，而是采取矫治教育措施。

二. 法律依据

本案的判决依据了《刑法修正案(十一)》的相关规定，该修正案明确了对已满12周岁不满14周岁者犯故意杀人罪且情节恶劣的，经最高检核准可追诉刑责。本案中，最高检于2024年4月核准追诉，为司法实践树立了新标杆。

三. 判决意义

本案的判决不仅体现了法律对未成年人犯罪的严惩态度，也体现了对未成年人司法保护的原则。通过区分主从犯和犯罪情节，法院作出了公正合理的判决，既维护了法律的威严，也保护了未成年人的合法权益。同时，本案也警示我们，家庭、学校和社会应共同关注未成年人的成长和教育，预防未成年人犯罪的发生。

综上所述，初中杀人案的三位杀人犯分别被判处无期徒刑、十二年有期徒刑和不予刑事处罚。这一判决结果既体现了法律的公正和威严，也体现了对未成年人司法保护的原则。如有进一步需要，您可以继续咨询我。