在库房申请退租后没及时搬离的情况下，甲方无权擅自锁门。以下是对此问题的详细分析：

1. 租赁合同终止后的权利与义务：

   • 租赁期限届满或租赁合同提前解除后，租赁关系终止。此时，甲方作为出租人，有权收回房屋，但应依法行使权利。
   • 乙方作为承租人，在租赁关系终止后，有义务及时搬离并交还房屋。

2. 甲方锁门行为的合法性分析：

   • 若乙方未及时搬离，甲方擅自锁门可能构成对乙方财产权的侵犯。因为租赁关系终止后，乙方对房屋内的财物仍享有所有权或占有权。
   • 甲方应通过合法途径处理乙方未搬离的情况，如与乙方协商解决、向法院提起诉讼等。

3. 乙方未及时搬离的法律后果：

   • 乙方应承担因未及时搬离而给甲方造成的损失，如房屋空置期间的租金损失等。
   • 若甲方因此提起诉讼，乙方可能面临被法院判决支付违约金、赔偿损失等法律后果。

4. 建议与处理方式：

   • 甲方应与乙方进行沟通，了解乙方未及时搬离的原因，并协商解决方案。
   • 若协商无果，甲方可以依法向法院提起诉讼，要求乙方承担相应的法律责任。
   • 在诉讼过程中，甲方应保留相关证据，如租赁合同、双方沟通记录等，以证明自己的主张。

综上所述，库房申请退租后没及时搬离时，甲方无权擅自锁门。甲方应通过合法途径处理乙方未搬离的情况，并保留相关证据以维护自己的合法权益。若你有进一步的法律问题或需要具体的法律帮助，请直接向我咨询。