针对您提出的“被告不同意证据作为鉴定材料怎么办”的问题，以下是我为您提供的详细解答：
首先，我们需要明确司法鉴定的目的与重要性。司法鉴定在诉讼过程中起着至关重要的作用，它旨在为法庭提供科学、客观的证据，帮助法官准确认定案件事实并作出公正裁决。因此，无论是原告还是被告，都应当充分认识到司法鉴定的严肃性和必要性。
当原告提出鉴定申请，而被告不同意时，处理方式会因诉讼类型的不同而有所差异，但通常会遵循以下原则：
法院审查鉴定的必要性：
- 在民事诉讼中，如果鉴定对查明案件的关键事实至关重要，且符合法律所规定的鉴定情形，即使被告不同意，法院也有权依职权决定进行鉴定。
- 法院会综合考虑案件的具体情况、鉴定的必要性以及是否损害被告的合法权益等因素，作出是否准许鉴定的决定。
被告的应对策略：
- 被告应当积极向法庭阐述不同意的理由，如果认为鉴定并非必要或者鉴定程序存在瑕疵，可以向法庭提出书面异议。
- 如果法庭决定进行鉴定，被告应当配合鉴定程序，否则可能会面临不利的法律后果，如法院可能推定原告主张的相关事实成立。
被告的异议途径：
- 被告可以在收到鉴定意见后及时向法庭提交书面异议，详细阐述不同意的理由和依据。
- 如果认为原鉴定存在严重问题，可以向法庭申请重新鉴定，由双方共同认可或法院指定的鉴定机构进行。
- 被告还有权请求法庭对鉴定机构的资质、鉴定人员的专业能力以及鉴定过程的合规性进行调查核实。
遵守法庭决定与后续行动：
- 无论被告是否同意鉴定意见，最终都需要遵守法庭的决定。如果法庭采纳了鉴定意见作为判决依据，被告应当按判决要求履行相应义务。
- 在处理司法鉴定异议时，被告应当注重保留证据，及时收集与鉴定相关的所有材料以备不时之需。
此外，如果被告在刑事诉讼中面临司法鉴定的问题，处理方式会有所不同。在刑事诉讼中，控方承担举证责任，鉴定程序的进行一般不受被告影响。但如果被告对鉴定结果有异议，可以申请重新鉴定，并需要说明理由，由法院决定是否准许。
综上所述，当被告不同意证据作为鉴定材料时，应当通过合法途径积极表达异议并参与后续程序。同时，遵守法庭决定并寻求必要的专业支持也是维护自身合法权益的重要途径。希望这个解答能够对您有所帮助。