非法入侵他人店铺是一种违法行为，其处理方式主要依据入侵行为的性质和严重程度来决定。以下是对此问题的详细解答：

一、法律依据

1. 《治安管理处罚法》：对于轻微的非法入侵行为，如未造成严重后果或情节不严重，通常依据此法进行处罚。处罚方式可能包括行政罚款、行政拘留等。

2. 《刑法》：若非法入侵行为情节严重，如造成重大财产损失、人身伤害或严重扰乱社会秩序，则可能触犯刑法。特别是《刑法》第245条规定的非法侵入住宅罪，虽然主要针对住宅，但店铺作为经营场所，其非法入侵行为在性质上也可能被视为类似行为，从而受到相应的刑事处罚，如三年以下有期徒刑等。

二、处理方式

1. 报警：一旦发现店铺被非法入侵，应立即报警。警方会迅速出警，对现场进行勘查，并收集相关证据。

2. 配合调查：作为受害者，应积极配合警方的调查工作，提供尽可能多的线索和证据，如监控录像、入侵者的特征描述等。

3. 法律诉讼：若入侵行为造成了财产损失或人身伤害，受害者可以通过法律途径追究入侵者的民事责任，要求其赔偿损失。同时，若入侵行为触犯刑法，警方会依法将其移送检察机关审查起诉。

4. 加强防范：为了避免类似事件再次发生，受害者应加强店铺的安全防范措施，如安装监控设备、加强门窗锁具的安全性等。

三、注意事项

1. 保留证据：在处理非法入侵事件时，务必保留好所有相关证据，以便后续的法律诉讼或调解使用。

2. 及时报警：不要试图自行处理或私了，以免错过最佳的报警时机和证据收集机会。

3. 法律咨询：在处理过程中，如有需要，可以寻求专业律师的法律咨询和帮助，以确保自己的合法权益得到充分保障。

综上所述，非法入侵他人店铺是一种违法行为，其处理方式应依据入侵行为的性质和严重程度来决定。受害者应积极配合警方调查，并通过法律途径追究入侵者的责任。同时，加强店铺的安全防范措施也是预防类似事件再次发生的重要措施。