针对您提出的“股东出资纠纷清算方案”问题，以下是一个清晰、详细且有深度的解答：

一、清算原因与启动

首先，需要明确公司进入清算程序的原因。通常，这包括公司章程规定的营业期限届满、股东会作出解散决议、公司被依法宣告破产等情况。一旦确定清算原因，公司应及时启动清算程序。

二、成立清算组

清算组是负责公司清算工作的核心机构，由股东等相关人员组成。清算组的主要职责包括清理公司财产、编制资产负债表和财产清单、通知债权人申报债权等。清算组的成立应严格遵循法定程序，并确保其成员具备相应的专业知识和能力。

三、清理公司财产与债权申报

清算组应对公司的各类财产进行全面清查，包括固定资产、流动资产、无形资产等，并编制详细的资产负债表和财产清单。同时，清算组应及时通知债权人申报债权，并按照规定的时间和要求进行债权登记和确认。

四、制定清算方案

清算方案是清算工作的核心文件，它应依据清理结果制定，并明确清算费用、职工工资、社会保险费用和法定补偿金的支付顺序，以及税款的缴纳和债务的清偿顺序。在制定清算方案时，应充分考虑股东的出资比例和持股比例，确保剩余财产的公平分配。

清算方案的具体内容应包括：

1. 清算费用的支付：包括清算组人员的工资、办公费用等。
2. 职工工资、社会保险费用和法定补偿金的支付：确保职工权益得到保障。
3. 税款的缴纳：按照税法规定缴纳公司应缴税款。
4. 债务的清偿：按照法定顺序清偿公司债务。
5. 剩余财产的分配：有限责任公司按股东出资比例分配，股份有限公司按股东持股比例分配。

五、确认与执行清算方案

清算方案制定完成后，应报股东会、股东大会或者人民法院确认。确认无误后，清算组应按照清算方案执行清算工作，包括支付清算费用、清偿债务、分配剩余财产等。

六、制作清算报告并注销登记

清算结束后，清算组应制作清算报告，详细反映清算过程、清算结果以及剩余财产的分配情况。同时，清算组应向公司登记机关申请注销公司登记，标志着公司清算工作的正式结束。

七、纠纷解决途径

在清算过程中，如果股东之间出现纠纷，应首先通过协商、调解等方式解决。协商不成的，可以按照公司章程或协议的约定提起诉讼。法院将依法审查清算程序的合法性以及剩余财产的分配情况，确保股东权益和清算公正。

综上所述，股东出资纠纷的清算方案应涵盖清算原因与启动、成立清算组、清理公司财产与债权申报、制定清算方案、确认与执行清算方案、制作清算报告并注销登记以及纠纷解决途径等多个方面。通过严格遵循法定程序和执行清算方案，可以确保股东间纠纷及公司清算的公平、公正处理。