在房屋裂缝因果关系不确定的情况下，仍然可以进行损失鉴定。具体分析如下：

一. 房屋损失鉴定与因果关系鉴定的独立性

1. 损失鉴定的独立性：房屋损失鉴定主要是评估房屋因裂缝等原因造成的实际损失，如修复费用、贬值等。这一鉴定过程并不直接依赖于裂缝产生的具体因果关系，而是基于房屋当前的实际状况进行评估。
2. 因果关系鉴定的另行处理：虽然因果关系的确定对于责任划分和赔偿至关重要，但它并不影响损失鉴定的进行。因果关系的不确定可以留待后续通过其他证据或专业鉴定来明确。

二. 损失鉴定的法律依据与程序

1. 法律依据：根据《建筑法》《城市房屋管理法》等相关法律法规，房屋损坏的鉴定工作可以由具有相应资质的机构进行，这些机构包括政府房屋管理和建设部门、司法鉴定机构、获得资质认证的第三方检测评估机构等。
2. 鉴定程序：在选择合适的鉴定机构后，按照其规定的程序提交鉴定申请，并提供必要的房屋状况资料。鉴定机构将依据专业知识和技术手段，对房屋裂缝造成的损失进行客观、公正的评估。

三. 实际操作的建议

• 并行处理：在因果关系不确定的情况下，建议同时推进损失鉴定和因果关系调查。这样既可以及时明确房屋的实际损失，又为后续的责任划分和赔偿提供有力依据。
• 选择专业机构：确保选择的鉴定机构具有相应的资质和信誉，以保证鉴定结果的准确性和公正性。

我建议：在房屋裂缝因果关系不确定时，您应尽快联系具有资质的鉴定机构进行损失鉴定，并同时关注因果关系的调查。如有进一步需要，您可以继续咨询我。