在走私案件中，违法所得的认定是一个关键问题，通常由特定的司法机关或机构来负责。以下是对这一问题的详细解答：

走私案件违法所得由谁认定：

1. 司法机关的认定：

   • 在走私刑事案件的侦查、起诉和审判过程中，违法所得的认定主要由公安机关（走私犯罪侦查机构）、检察机关和法院负责。
   • 公安机关在侦查阶段会收集相关证据，对走私行为及其违法所得进行初步认定，并随案移送检察机关。
   • 检察机关在审查起诉阶段，会对公安机关移送的案件材料和证据进行审查，包括对违法所得的认定进行复核。
   • 法院在审判阶段，根据庭审情况和相关证据，最终对违法所得进行确认，并作出相应的判决。

2. 海关的认定：

   • 对于不构成刑事犯罪的走私案件，海关在依法作出行政处罚时，也会对违法所得进行认定。
   • 海关根据查获的走私物品、相关证据以及法律法规的规定，确定违法所得的数额，并据此作出行政处罚决定。

3. 法律依据：

   • 根据《刑法》及相关司法解释的规定，违法所得是指犯罪分子违法所得的一切财物，应当予以追缴或者责令退赔。
   • 在走私案件中，违法所得的认定需要依据相关法律法规和司法解释的规定进行，确保认定的准确性和合法性。

综上所述，走私案件中的违法所得主要由司法机关（公安机关、检察机关、法院）和海关进行认定。在刑事案件中，司法机关负责侦查、起诉和审判，并对违法所得进行确认和判决；在行政案件中，海关负责依法作出行政处罚，并对违法所得进行认定。如果你对此类问题有进一步的疑问或需要具体的法律帮助，请直接向我咨询。