买卖合同纠纷超过三年，合同仍然有效，但主张权利时可能会面临诉讼时效的问题。下面我详细为您解释：
合同效力与时间无关：买卖合同的效力并不因时间的流逝而自动失效。只要合同的主体合适（即双方具有相应的民事行为能力）、意思表示真实（即不存在欺诈、胁迫等情形），且合同内容合法合规、不违反公序良俗，那么该合同就是有效的。无论合同签订了多久，只要这些生效要件没有缺失，合同就持续有效。
诉讼时效的考量：虽然合同持续有效，但《民法典》规定，向人民法院请求保护民事权利的诉讼时效期间通常为三年。这意味着，如果一方在合同签订后三年内没有向对方主张权利（如要求支付货款、履行义务等），那么当对方以诉讼时效已过为由进行抗辩时，主张权利的一方可能会面临败诉的风险。然而，这并不影响合同本身的效力。
诉讼时效的中断与中止：值得注意的是，诉讼时效并非一成不变。在特定情况下，如债权人向债务人主张权利、债务人同意履行义务等，诉讼时效可能会中断并重新计算。同样，如果存在不可抗力等导致诉讼时效中止的情况，诉讼时效也会暂停计算。
综上所述，买卖合同纠纷超过三年，合同本身仍然有效。但在主张权利时，需要充分考虑诉讼时效的问题。如果您遇到了类似的纠纷，建议尽快与我联系，以便我能为您提供更具体的法律建议和帮助。