工程经营部不能作为个体行业的组织形式。下面我将从相关法律角度进行解释：

在我国，个体行业的组织形式通常指的是个体工商户，它是根据《个体工商户条例》等相关法律法规设立，由个人或者家庭经营，依法承担无限责任的经营实体。而工程经营部，从名称上来看，更像是一个企业内部的部门或者分支机构，并不是一个独立的法律主体。

首先，从法律地位上分析，工程经营部作为企业内部的一个组成部分，它并不具备独立的法人资格，也不能独立承担民事责任。因此，它不能作为个体行业的组织形式存在。

其次，从注册登记的角度来看，个体工商户的注册登记需要按照相关法律法规的规定进行，包括名称、经营场所、经营范围、经营者等信息的登记。而工程经营部作为企业内部部门，并不需要进行独立的注册登记，也没有独立的经营资格。

综上所述，工程经营部不能作为个体行业的组织形式。如果你有相关的法律问题或者需要进一步的法律咨询，可以直接向我提问，我会尽我所能为你解答。