关于“自然人独资的公司谁来负责任”这个问题，我可以从以下几个方面为您详细解答：

结论前置

自然人独资的公司（即一人有限责任公司）在责任承担上，首先由公司以其全部财产对公司的债务承担责任。股东通常以其认缴的出资额为限对公司承担责任。但在特定情形下，如股东不能证明公司财产独立于自己财产，或滥用公司法人独立地位和股东有限责任逃避债务时，股东可能需要对公司债务承担连带责任。

详细解答

1. 公司的独立责任：

   • 一人有限责任公司作为独立的法人主体，拥有独立的法人财产权。公司债务首先由公司自身的资产来清偿，与股东个人的其他财产无关。

2. 股东的有限责任：

   • 在一般情况下，股东以其认缴的出资额为限对公司承担责任。例如，如果股东认缴出资50万元设立一人有限责任公司，那么即使公司对外负债远超50万元，股东也无需再额外拿出个人财产偿债（特殊情况除外）。

3. 特殊情形下的连带责任：

   • 根据《中华人民共和国公司法》第六十三条的规定，如果一人有限责任公司的股东不能证明公司财产独立于股东自己的财产的，应当对公司债务承担连带责任。这主要是为了防止股东滥用公司法人独立地位和股东有限责任，逃避债务，从而损害公司债权人的利益。
   • 股东滥用公司法人独立地位和股东有限责任的常见表现包括：股东无偿使用公司资金或财产且不作财务记载；用公司资金偿还股东债务或将公司资金供关联公司无偿使用且不作财务记载；公司与股东之间的交易收益归股东，损失却由公司承担等。当这些行为严重损害公司债权人利益时，股东需要对公司债务承担连带责任。

4. 清算时的债务清偿顺序：

   • 在公司进行清算时，首先以公司的财产来清偿债务。只有当公司财产清偿完毕后，若仍有债务未得到清偿，股东才在其出资范围内承担补充清偿责任。

综上所述，自然人独资的公司在责任承担上遵循“公司独立责任为主，股东有限责任为辅，特定情形下连带责任”的原则。在实际运营中，公司应严格区分公司财产与股东个人财产，避免混同，以维护公司的独立法人地位和股东的有限责任。如果您在这方面有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。