保密要害部门定责的三个步骤主要包括：

一、明确责任

在这个步骤中，需要明确各级保密委员会、保密工作机构以及内设各部门的职责。具体来说，机关、单位的保密委员会负责确定和调整本机关、本单位的保密要害部门部位；保密工作机构则负责具体组织和督办相关工作；而内设各部门则负责确定工作的具体落实，确保各自部门内的保密工作得到有效执行。

二、开展调研

调研是确定保密要害部门部位的关键步骤。机关、单位的保密工作机构和各内设部门需要对照业务领域保密事项范围和部门工作职责，对内设机构及各工作岗位的涉密程度进行全面深入的调查研究和分析评估。这一步骤的目的是为了准确识别哪些部门或部位涉及国家秘密，以及涉密的程度和范围，从而为后续的确定和管理工作提供科学依据。

三、申请报批

在完成调研工作后，机关、单位的保密工作机构需要将保密要害部门部位的确认材料报本机关、本单位保密委员会领导审批。审批通过后，还需报送有关保密行政管理部门进行确认。这一步骤是确保保密要害部门部位的确定符合法定程序和要求，也是加强保密管理的重要环节。在申请报批过程中，需要提交包括申请书、登记表、位置图和内部平面图等相关材料，以便保密行政管理部门进行审核和确认。

综上所述，保密要害部门定责的三个步骤是明确责任、开展调研和申请报批。这三个步骤相互衔接、环环相扣，共同构成了确定保密要害部门部位的完整流程。通过严格执行这些步骤，可以有效加强机关、单位的保密管理，确保国家秘密的安全。