土地承包确权亩数通常是有底档的。具体分析如下：

一. 土地承包确权与底档的关系

1. 确权过程：土地承包确权是政府对农户承包土地的面积、位置、四至等进行的确认，并颁发土地承包经营权证。这一过程中，相关部门会进行详细的测量和登记。
2. 底档保存：这些测量和登记的数据，包括土地承包确权的亩数，通常会被记录在政府的档案中，形成底档。这些底档是土地承包经营权的重要证明，也是处理土地纠纷的重要依据。

二. 相关法律法规依据

• 根据《中华人民共和国农村土地承包法》及相关实施细则，政府应当对土地承包进行确权，并颁发土地承包经营权证。同时，这些确权数据和资料应当妥善保存，以备查阅。

三. 实际应用

• 在实际中，如果农户对土地承包确权的亩数有异议，或者发生土地纠纷，可以查阅这些底档来核实情况。底档的存在，为土地权益的保障提供了有力的支持。

综上所述，土地承包确权亩数通常是有底档的，这些底档是土地承包经营权的重要证明，也是处理土地纠纷的重要依据。如有进一步需要，您可以继续咨询我。