关于基本农田被非法侵占的补偿标准，这是一个涉及多重因素并需依据相关法律法规来确定的复杂问题。以下是对此问题的详细解答：
一、核心原则
首先，需要明确的是，基本农田作为国家重要的耕地资源，其被非法侵占是严重违法的行为。对于这类情况，补偿标准的制定需遵循公平、合理、科学的原则，并确保被征地农民的生活水平不降低、长远生计有保障。
二、法律依据
根据《中华人民共和国土地管理法》及其相关法规，征收土地（包括基本农田）应给予公平、合理的补偿。具体补偿标准由省、自治区、直辖市通过制定公布区片综合地价来确定，并至少每三年调整或重新公布一次。这一规定为补偿标准的制定提供了明确的法律基础。
三、补偿构成及标准
土地补偿费：
- 这是对土地所有者在土地上的投入和收益的补偿。补偿标准主要依据区片综合地价来确定，归农村集体经济组织所有。不同地区的区片综合地价存在显著差异，经济发达地区通常较高。
安置补助费：
- 用于安置因土地被征收而造成的多余劳动力。其标准也是基于区片综合地价，并结合需要安置的农业人口数来计算。通常，每个需要安置的农业人口的安置补助费标准，为该耕地被征收前三年平均年产值的四至六倍，但最高不得超过十五倍。
地上附着物和青苗的补偿费：
- 这包括对被征收土地上的建筑物、构筑物（如房屋、水井）的拆除和恢复费用，以及对处于生长阶段农作物的补偿。具体标准由省、自治区、直辖市规定，一般按实际价值或产值计算。
社会保障费用：
- 主要用于被征地农民的养老保险等社会保险缴费补贴。其标准由省、自治区、直辖市根据当地经济社会发展水平和被征地农民年龄结构等因素确定。
四、影响补偿标准的关键因素
- 土地类型与性质：基本农田作为特殊类型的耕地，其补偿标准通常较高。
- 地理位置：城市中心或经济发达地区的耕地补偿标准通常高于偏远或经济欠发达地区。
- 占地面积：被占用耕地面积越大，补偿金额相应增加。
- 土地年产值：年产值较高的土地，其补偿标准也相应提高。
- 当地经济发展水平：经济发达地区由于土地资源稀缺性和价值较高，补偿标准相应提升。
- 政府政策与法规：政府的相关政策和法规对补偿标准产生直接影响，可能根据实际需要调整补偿政策。
五、建议与注意事项
- 及时咨询：面对基本农田被非法侵占的情况，建议立即咨询当地的土地管理部门或专业律师，以获取更具体、更准确的补偿标准和相关指导。
- 保留证据：注意保留相关证据，如土地权属证明、侵占现场照片等，以便在后续维权过程中使用。
- 依法维权：若补偿标准不合理或权益受到侵害，应依法通过诉讼、仲裁等途径维护自身权益。
综上所述，基本农田被非法侵占的补偿标准是一个复杂而重要的问题，需综合考虑多重因素并依据相关法律法规来确定。建议咨询当地相关部门或专业律师以获取更具体的指导和帮助。