生产、销售假冒他人注册商标的卷烟，应由司法机关依据刑法进行处罚。

一. 法律依据与处罚方式

1. 刑法规定：根据《最高人民法院最高人民检察院关于办理非法生产、销售烟草专卖品等刑事案件具体应用法律若干问题的解释》第一条，未经卷烟、雪茄烟等烟草专卖品注册商标所有人许可，在卷烟、雪茄烟等烟草专卖品上使用与其注册商标相同的商标，情节严重的，依照刑法第二百一十三条的规定，以假冒注册商标罪定罪处罚。这意味着，生产、销售假冒他人注册商标的卷烟，如果情节严重，将构成犯罪，由司法机关进行刑事处罚。

二. 处罚的具体情形

1. 假冒注册商标罪：如前所述，未经注册商标所有人许可，在卷烟上使用与其注册商标相同的商标，且情节严重的，将构成假冒注册商标罪。这里的“情节严重”通常指的是销售金额较大、影响恶劣、造成较大损失等情形。
2. 销售假冒注册商标的商品罪：如果销售明知是假冒他人注册商标的卷烟，且销售金额较大的，也将构成犯罪，依照刑法第二百一十四条的规定，以销售假冒注册商标的商品罪定罪处罚。

三. 处罚的严厉性

1. 刑事处罚：一旦构成假冒注册商标罪或销售假冒注册商标的商品罪，将面临严厉的刑事处罚，包括但不限于有期徒刑、拘役、罚金等。
2. 附加处罚：除了刑事处罚外，还可能面临没收违法所得、销毁非法销售的烟草专卖品等附加处罚。

我建议：对于生产、销售假冒他人注册商标的卷烟的行为，应坚决予以打击。相关企业和个人应增强法律意识，遵守法律法规，不从事任何违法违规的生产经营活动。如有进一步需要，您可以继续咨询我。