胚胎发育异常、孕囊不长的情况下，一般无法进行亲子鉴定。下面我对此进行详细分析：

一. 亲子鉴定的前提条件

1. 亲子鉴定通常需要在孩子出生后，使用孩子的样本（如血液、毛发等）与父母的样本进行比对。
2. 亲子鉴定的主要目的是确认父母与子女之间的生物学关系。

二. 胚胎发育异常、孕囊不长的影响

1. 胚胎发育异常或孕囊不长往往意味着胚胎发育存在问题，可能无法继续妊娠或胚胎发育停止。
2. 在这种情况下，胚胎可能还未发育到可以进行样本采集的阶段，或者即使采集到样本，也可能因为胚胎发育的异常而无法得到准确的鉴定结果。

三. 法律依据与实际操作

1. 根据亲子鉴定的常规操作，需要采集到孩子的生物样本才能进行鉴定。
2. 在胚胎发育异常、孕囊不长的情况下，由于胚胎可能尚未发育到可以采集样本的阶段，或者胚胎发育已经停止，因此无法进行亲子鉴定。

综上所述，由于胚胎发育异常、孕囊不长往往意味着胚胎发育存在问题，且可能无法采集到有效的生物样本，因此一般无法进行亲子鉴定。如果您有其他关于亲子鉴定或胚胎发育的问题，可以继续咨询我。