如果有限责任公司（自然人独资）不再经营，是需要进行注销的。以下是对这一结论的详细解释：

1. 法律依据：

   • 根据《中华人民共和国公司法》及相关规定，公司解散后应当进行清算，清算结束后应当办理注销登记。自然人独资的有限责任公司，作为公司的一种形式，同样需要遵循这一规定。

2. 注销的必要性：

   • 法律义务：公司不再经营时，及时进行注销是公司及其股东的法定义务。未按时注销可能导致法律责任，如被工商部门吊销营业执照，进而影响公司股东的个人信用。
   • 避免风险：注销公司可以避免因公司未履行相关义务（如税务申报、债务清偿等）而产生的法律风险和经济损失。
   • 资源释放：注销后，公司的名称、商标等资源可以被其他企业使用，有助于市场资源的合理配置。

3. 注销流程：

   • 成立清算组：由公司股东或指定人员组成清算组，负责公司财产的清算工作。
   • 清算财产：清算组需要编制财产清单，处理公司财产，并通知、公告债权人。
   • 清偿债务：用公司财产清偿公司债务，包括税费、员工工资、供应商款项等。
   • 编制清算报告：清算结束后，清算组需要编制清算报告，并经股东会确认。
   • 办理注销登记：携带清算报告、税务注销证明等文件，到工商部门办理注销登记手续。

4. 注意事项：

   • 在注销过程中，应确保所有债务已得到妥善清偿，避免留下法律纠纷。
   • 注销前需完成税务注销，确保公司无欠税情况。
   • 注销过程中需按照法定程序进行，否则可能导致注销无效或产生其他法律问题。

综上所述，如果有限责任公司（自然人独资）不再经营，应及时进行注销，以履行法律义务、避免风险并释放资源。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。