当大股东只借款不还时，公司可以采取以下步骤来妥善处理这一问题：

1. 查看公司章程与股东协议：

   • 首先，应查看公司章程及股东间的协议，看是否有关于股东借款的具体规定和处理办法。若章程或协议中有明确规定，则应按照这些规定来执行。

2. 书面催告还款：

   • 若章程或协议中无相关规定，或规定不明确，公司可以书面发函催告大股东还款。在函件中，应明确告知还款的期限以及不按时还款可能产生的后果，如法律诉讼等，并保留好函件及送达凭证。

3. 股东会决议：

   • 若大股东借款用于公司经营，且长期未还，公司可以召开股东会决议，要求大股东偿还借款，以此维护公司利益。

4. 法律诉讼：

   • 若大股东在收到催款函后仍不还款，公司可以通过诉讼途径解决。在诉讼过程中，公司需提供与借款相关的充分证据，如借款合同、转账记录、催款函等。法院通常会根据证据情况支持公司的诉求，判决大股东还款。
   • 若大股东拒不执行法院判决，公司可以向法院申请强制执行。法院有权查询、冻结、划拨大股东的财产，以此促使大股东履行还款义务。

5. 考虑税务与法律责任：

   • 大股东长期借款不还，还可能涉及税务和责任问题。如借款跨年未还且未用于公司经营，可能被视作分红，需缴纳个人所得税。
   • 若大股东借款行为损害公司利益或其他股东利益，受损方也可依法主张赔偿。

在处理这一过程中，公司应遵循法定程序，确保所有行动都合法合规，以维护公司及股东的合法权益。同时，也建议公司在日常经营中加强财务管理和内部控制，避免类似问题的再次发生。如果您在此过程中遇到任何法律问题或需要进一步的法律建议，可以直接向我咨询。