关于“公司违规资金不明确怎么办”的问题，首先我们需要明确一点：公司资金违规是一个严重的问题，可能涉及到法律责任和财务风险。如果资金情况不明确，需要采取一系列措施来查明真相并妥善处理。以下是我给出的具体建议：

1. 立即开展内部调查：

   • 组建一个由专业人士（如法务、财务、审计等）组成的调查小组，对公司资金进行全面、细致的审查。
   • 审查范围应包括但不限于资金流向、交易记录、合同文件等，以查明资金违规的具体情况和原因。

2. 聘请外部专业机构协助：

   • 如果内部调查难以进行或结果存疑，可以考虑聘请外部会计师事务所或律师事务所进行专业审计或法律咨询。
   • 外部机构能够提供更客观、专业的意见，帮助公司更准确地了解资金状况。

3. 加强内部控制和监管：

   • 完善公司内部控制制度，明确资金使用的审批流程和责任分工。
   • 加强对财务人员的培训和管理，提高其专业素养和职业道德水平。
   • 定期对资金使用情况进行审计和检查，及时发现并纠正违规行为。

4. 依法处理违规行为：

   • 如果调查发现存在资金违规行为，应依法追究相关人员的法律责任。
   • 根据违规行为的性质和严重程度，采取相应的法律措施，如民事赔偿、行政处罚或刑事追诉等。

5. 及时披露和沟通：

   • 如果资金违规情况可能对公司股东、债权人等利益相关者产生重大影响，应及时进行信息披露。
   • 与利益相关者保持沟通，解释资金违规的原因和处理措施，以维护公司的信誉和形象。

综上所述，面对公司违规资金不明确的情况，应立即采取行动查明真相，并依法处理违规行为。同时，加强内部控制和监管，防止类似问题再次发生。如果您在处理过程中遇到任何法律问题或需要进一步的法律建议，请随时向我咨询。