对于两公司对账单只加盖公章是否可以的问题，这主要取决于对账单的具体性质、用途以及相关法律法规或公司内部规定的要求。以下是对此问题的详细解答：

一、对账单的性质与用途

1. 对账单定义：对账单通常是两个或多个经济实体之间，为了核对交易记录、确认账目无误而制作的一种书面文件。
2. 用途：对账单的主要用途是确保双方交易记录的准确性和一致性，避免账目上的误差或纠纷。

二、加盖公章的法律效力

1. 公章的法律意义：公章是公司法人权力的象征，加盖公章通常意味着公司对该文件内容的确认和承担法律责任。
2. 法律效力：在大多数情况下，加盖公章的对账单具有法律效力，可以作为双方交易记录的凭证。

三、是否只需加盖公章

1. 一般情况：如果对对账单的准确性和合法性没有特殊要求，且双方公司均认可仅加盖公章的方式，那么只加盖公章是可以的。
2. 特殊情况：然而，在某些特定情况下，如涉及大额交易、敏感信息或法律法规有明确要求时，可能还需要其他形式的确认或审批。例如，可能需要双方公司法定代表人或授权代表的签字，或者需要附上相关交易凭证的复印件等。

四、建议与注意事项

1. 明确约定：为确保对账单的准确性和法律效力，建议双方在对账单上明确约定核对范围、核对方式、核对结果以及争议解决方式等条款。
2. 合规性检查：在加盖公章前，双方应仔细核对对账单内容，确保其准确无误，并符合相关法律法规和公司内部规定的要求。
3. 保留证据：加盖公章后，双方应妥善保管对账单原件或复印件，以备后续查询或争议解决之需。

综上所述，两公司对账单只加盖公章在一般情况下是可以的，但具体还需根据对账单的性质、用途以及相关法律法规或公司内部规定的要求来确定。为确保对账单的准确性和法律效力，建议双方在进行对账时遵循相关法律法规和公司规定，并明确约定相关条款。