业务员欠公司货款立案转交检察院后，检察院将对案件进行审查起诉程序。以下是具体的处理流程：
一. 案件审查阶段
案件接收与审查
- 检察院在接到公安机关移交的涉嫌业务员拖欠公司货款的刑事案件后，将首先对案件进行全面审查。根据《中华人民共和国刑事诉讼法》第一百七十三条，检察院会讯问犯罪嫌疑人（即业务员），并听取辩护人、被害人（即公司）及其诉讼代理人的意见，以确保案件处理的公正性和合法性。
证据核查
- 在案件审查过程中，检察院会对案件相关证据进行仔细核查。这些证据包括但不限于合同、交易记录、付款凭证等，以确认是否存在业务员拖欠公司货款的事实，并查明拖欠货款的原因和性质。
二. 法律适用与决定阶段
法律适用判断
- 检察院会根据核查的证据，判断案件是否涉及犯罪行为。若业务员拖欠货款的行为涉嫌犯罪，如合同诈骗罪（根据《中华人民共和国刑法》第二百二十四条，合同诈骗罪是指以非法占有为目的，在签订、履行合同过程中，骗取对方当事人财物，数额较大的行为），则检察院将依法处理。
起诉或不起诉决定
- 若检察院认为案件事实清楚，证据确实、充分，且业务员的行为涉嫌犯罪，将依法向法院提起公诉。若检察院认为案件证据不足或不符合起诉条件，可能会要求公安机关补充侦查，或者直接作出不起诉决定。
三. 案件移送与执行监督阶段
案件移送
- 对于涉嫌犯罪的案件，检察院在决定提起公诉后，会将案件移送至有管辖权的人民法院进行审判。
监督与执行
- 在案件处理过程中，检察院会依法对公安机关的侦查活动和法院的审判活动进行监督，确保案件的公正处理。同时，对于法院判决的执行情况，检察院也会进行监督，确保公司的合法权益得到有效保障。
我建议：
- 公司作为被害人，应积极配合检察院的工作，提供必要的证据和协助，以确保案件的顺利处理。
- 关注案件进展，及时了解检察院和法院的处理结果，以便采取相应的法律措施维护自身权益。
- 如有进一步需要，您可以继续咨询我，我将为您提供更详细的法律分析和建议。