村级自治组织不能进行企业投资备案。下面我将从法律角度进行详细分析：

一. 村级自治组织的法律地位与职责

1. 法律地位：村级自治组织，如村民委员会，是根据《中华人民共和国村民委员会组织法》设立的基层群众性自治组织，负责办理本村的公共事务和公益事业，调解民间纠纷，协助维护社会治安等。
2. 职责范围：其职责主要围绕村民的自治管理、集体经济的发展以及村民权益的保护等，并不包括直接参与或管理企业的投资备案活动。

二. 企业投资备案的主体要求

1. 主体资格：企业投资备案通常是由具有法人资格的企业或相关经济组织进行，需要遵循国家关于企业投资、工商注册、税务登记等方面的法律法规。
2. 村级自治组织的不适用性：村级自治组织作为自治性组织，并不具备法人资格，也无法直接从事或管理企业的投资活动，因此不能进行企业投资备案。

三. 法律依据

• 根据《中华人民共和国村民委员会组织法》的相关规定，村民委员会的主要职责是管理本村事务，并未赋予其进行企业投资备案的权力。
• 同时，国家关于企业投资备案的法律法规也明确规定了备案的主体资格，村级自治组织并不符合这些要求。

综上所述，村级自治组织不能进行企业投资备案。这是由其法律地位、职责范围以及企业投资备案的主体要求所决定的。如有进一步需要，您可以继续咨询我。