医生集团承包科室在大多数情况下是违法的。这种行为违反了《医疗机构管理条例》及相关法律法规，不仅可能扰乱正常的医疗秩序，还可能对患者的健康和生命安全构成严重威胁。以下是对此问题的详细分析：
法律依据与分析
《医疗机构管理条例》明确规定，医疗机构执业必须遵守有关法律、法规和医疗技术规范，以救死扶伤、防病治病、为公民的健康服务为宗旨。医院将科室承包出去的行为，违背了医疗机构应依法依规执业的要求，扰乱了正常的医疗管理秩序。
相关政策文件也严禁任何形式的“科室承包”“科室出租”等行为，旨在规范医疗机构的运营模式，保证医疗服务的质量和安全，维护患者的合法权益。
根据相关法律批复，医疗机构若将科室或房屋承包、出租给非本医疗机构人员或其他机构，并以本机构名义开展诊疗活动，将按照《医疗机构管理条例》的相关规定予以处罚。这种行为被视为变相的非法行医，因为承包科室的主体可能不具备相应的医疗资质和能力。
法律后果
对医院的处罚：医院若违反相关规定，将可能面临没收非法所得、罚款甚至吊销《医疗机构执业许可证》的处罚。这将对医院的声誉和运营造成严重影响。
赔偿患者损失：如果承包科室在诊疗过程中给患者造成损害，医院作为责任主体，需要承担相应的赔偿责任。这不仅包括患者的直接经济损失，还可能包括精神损害抚慰金等。
特殊情况说明
虽然一般情况下医生集团承包科室是违法的，但在某些特定情况下，如双方以合作共建的形式开展医疗业务，且符合相关法律法规和政策要求，可能不构成违法。但这种合作模式需要严格遵循相关法律法规和政策规定，确保医疗服务的质量和安全。
综上所述，医生集团承包科室在大多数情况下是违法的，这种行为不仅违反了相关法律法规和政策规定，还可能对患者的健康和生命安全构成严重威胁。因此，建议医疗机构和医生集团严格遵守相关法律法规和政策规定，确保医疗服务的合法性和安全性。如果您有任何关于医疗纠纷、医疗损害或医疗事故鉴定等方面的问题，可以直接向我咨询。