针对你提出的“酒驾法院判交警程序有瑕疵但没有撤销当事人的行政处罚该怎么办”的问题，我给出以下分析：

核心结论：

当酒驾案件中被法院指出交警程序存在瑕疵，但并未撤销当事人的行政处罚时，当事人仍需按原行政处罚决定来履行，同时可以考虑通过法律途径对程序瑕疵问题提出异议或申诉。

详细分析：

1. 行政处罚的有效性：

   • 即便法院指出交警在处理酒驾案件时程序上存在瑕疵，但这并不意味着行政处罚决定自动失效。除非法院明确撤销或改变该行政处罚，否则当事人仍需按原决定来履行，如缴纳罚款、接受暂扣或吊销驾驶证等处罚。

2. 程序瑕疵的影响：

   • 程序瑕疵可能指的是交警在执法过程中未严格遵守相关法律法规规定的程序要求，如未按规定进行酒精检测、未告知当事人相关权利等。这些瑕疵可能影响行政处罚的合法性和公正性，但不一定导致行政处罚的完全无效。

3. 法律途径：

   • 当事人对行政处罚决定不服，或者认为程序瑕疵严重影响了自己的合法权益，可以通过法律途径提出异议或申诉。这通常包括向上一级公安机关交通管理部门申请行政复议，或者向人民法院提起行政诉讼。
   • 在提出异议或申诉时，当事人需要提供充分的证据来证明程序瑕疵的存在，以及这些瑕疵如何影响了行政处罚的合法性和公正性。

4. 建议：

   • 当事人在面对这种情况时，应首先咨询专业律师，了解自己的法律权益和可能的法律途径。
   • 同时，当事人也应积极配合交警部门的调查和处理，避免因为程序瑕疵而引发更大的法律纠纷。

综上所述，当酒驾案件中被法院指出交警程序存在瑕疵但并未撤销行政处罚时，当事人应首先按原行政处罚决定来履行，并通过法律途径对程序瑕疵问题提出异议或申诉。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。