事业单位人员长期病假超过三年，可能不享受当年的年休假，且单位有权依据相关规定处理其病假事宜。具体分析如下：

一. 病假与年休假的关系

1. 年休假规定：根据《职工带薪年休假条例》第三条，职工累计工作已满10年不满20年的，年休假10天。但此条例同时也规定了职工请病假累计达到一定时间后，不享受当年的年休假。具体来说，累计工作满10年不满20年的职工，请病假累计3个月以上的，不享受当年的年休假。
2. 长期病假的影响：事业单位人员若长期病假超过三年，显然已远超“累计3个月以上”的标准，因此不享受当年的年休假。

二. 事业单位对长期病假的处理

1. 单位权限：虽然《职工带薪年休假条例》未直接涉及事业单位对长期病假的具体处理，但事业单位通常有权依据内部规章制度或劳动合同约定，对长期病假员工进行管理。这可能包括调整岗位、降低薪资、甚至解除劳动关系等措施。
2. 建议与单位沟通：事业单位人员若因长期病假面临单位处理，建议首先与单位沟通，了解具体政策，并尽可能提供医疗证明等必要文件，以争取合理的病假待遇。

三. 特殊情况说明

• 例如，若事业单位人员长期病假是因工伤导致，那么其病假待遇及年休假规定可能受《工伤保险条例》等特定法规保护，需具体情况具体分析。

我建议，事业单位人员若长期病假超过三年，应主动与单位沟通，了解并遵守单位规章制度，同时关注自身权益保护。如有进一步需要，您可以继续咨询我。