姐姐有底案一般不会影响弟弟参军，但在某些特殊情况下可能会有所影响。

在征兵政治审查中，主要关注的是应征公民本人及其直系亲属的现实表现。根据我国目前现有的法律法规，并没有明确规定直系亲属有犯罪记录会直接导致其子女或兄弟姐妹不能参军入伍。因此，一般情况下，姐姐作为弟弟的直系亲属，其底案不会直接影响弟弟当兵的资格。

然而，也存在一些特殊情况。如果姐姐存在危害国家安全等严重犯罪行为的底案，且弟弟与姐姐共同生活并受其影响较大，这种情况下可能会对弟弟当兵产生一定的影响。政治审查会综合考虑应征公民的家庭背景、社会关系以及个人品质等多方面因素，因此，在特殊情况下，姐姐的底案可能会成为弟弟政审的一个考量点。

此外，如果直系血亲中有被判处死刑或者正在服刑的情况，也可能导致弟弟政审不合格。但这种情况并非绝对，具体还需根据当地征兵机构或相关部门的审查标准来判断。

总的来说，姐姐有底案是否会影响弟弟当兵，需要具体情况具体分析。建议有意参军的弟弟或其家长在报名前咨询当地征兵机构或相关部门，以获取最准确的信息和具体的审查标准。这样可以更好地了解自身的政审情况，避免因误解或信息不对称而错过参军的机会。