关于契税法中关于经济适用房以划拨方式取得土地使用权的特殊规定，以下是对这一问题的详细解答：
一、契税基本概念
契税是在我国境内转移土地、房屋权属时，由承受的单位和个人需要缴纳的一种税。其纳税义务人为承受土地、房屋权属的单位和个人。
二、划拨方式取得土地使用权的契税规定
一般情况：
- 划拨土地使用权是县级以上人民政府依法批准，将土地无偿交付给土地使用者使用的行为。由于这种方式不涉及土地使用权的交易或出让，在初始取得划拨土地使用权时，通常不需要缴纳契税。
特殊情况：
- 划拨转出让：如果先以划拨方式取得土地使用权，后经批准改为出让方式，土地性质发生变化，这相当于发生了土地使用权交易。此时，应依法缴纳契税，计税依据为补缴的土地出让金和其他出让费用。
- 房地产转让：经批准转让以划拨方式取得的房地产时，房地产转让者需要补缴契税。计税依据为补缴的土地使用权出让费用或土地收益。
- 改变土地用途：在某些地方，如果以划拨方式取得土地后改变土地用途，也可能需要补缴契税，具体规定需参照当地税收政策。
三、契税的缴纳
- 缴纳时间：契税的缴纳时间通常为纳税义务发生之日起90日内。对于期房，纳税人取得具有土地、房屋权属转移合同性质凭证的当日（即交房之日）视为纳税义务发生时间。
- 缴纳主体：一般为承受土地、房屋权属的单位和个人。但在某些特定情况下，如买卖双方有约定，也可能由卖方承担或共同承担。
四、注意事项与建议
- 了解当地政策：由于契税政策可能因地区而异，建议在实际操作前咨询当地税务部门或专业律师，了解具体的税收政策和操作流程。
- 合规缴纳：确保按照法规要求及时、足额缴纳契税，以避免不必要的法律风险和经济损失。
- 保留凭证：在缴纳契税后，务必妥善保管相关凭证和文件，以备未来可能需要的查询或审计。
综上所述，对于以划拨方式取得的经济适用房土地使用权及其后续的契税问题，需要根据具体情况和当地税收政策进行判断和操作。建议在实际操作中遵循相关法规和政策要求，确保合规性。