营运车一个周期内闯了3个红灯，每次违章将被处以200元罚款，记6分，且需缴纳滞纳金。一个周期内记分可能达到18分，驾驶员需重新参加科目一考试，考试通过后才能清分。具体分析如下：

1. 罚款与记分：

   • 根据《中华人民共和国道路交通安全法》第九十条，机动车驾驶人违反道路交通安全法律、法规关于道路通行规定的，处警告或者二十元以上二百元以下罚款。闯红灯属于违反道路通行规定的行为，因此每次闯红灯将被处以200元罚款。
   • 同时，根据《道路交通安全违法行为记分管理办法》第十条，驾驶机动车不按交通信号灯指示通行的，一次记6分。因此，闯3个红灯将累计记18分。

2. 滞纳金：

   • 闯红灯被罚款后，如果未在规定时间内缴纳罚款，还会产生滞纳金。滞纳金的具体金额和计算方式可能因地区而异，但通常会按照罚款金额的一定比例逐日累加。

3. 记分周期与清分：

   • 道路交通安全违法行为累积记分周期为12个月，满分为12分。如果在一个记分周期内记分达到或超过12分，驾驶员需要重新参加道路交通安全法律、法规和相关知识考试（即科目一考试）。
   • 考试合格后，记分予以清除，发还机动车驾驶证；考试不合格的，继续参加学习和考试，直至考试合格。

4. 对营运车的影响：

   • 作为营运车辆，频繁闯红灯不仅会影响驾驶员的记分和罚款情况，还可能对车辆的运营资质和信誉造成影响。因此，驾驶员应严格遵守交通规则，确保行车安全。

综上所述，营运车一个周期内闯了3个红灯将面临严重的法律后果，包括罚款、记分、缴纳滞纳金以及可能需要重新参加科目一考试。我建议驾驶员应严格遵守交通规则，确保行车安全，避免类似违章行为的发生。如有进一步需要，您可以继续咨询我。