长期逾期无力偿还但后来已还清，通常不会影响配偶的政审。以下是对此问题的详细分析：

一. 政审的考察内容

1. 主要关注点：政审主要考察的是个人的政治背景、道德品质、遵纪守法情况等，以判断其是否适合担任某些特定职务或参与某些特定活动。
2. 经济情况的考量：虽然经济情况也是政审的一个方面，但通常关注的是是否存在重大的经济犯罪或违法行为，而非一般的经济困难或债务问题。

二. 逾期偿还与政审的关系

1. 已还清的情况：题目中明确提到“后来还清了”，这意味着逾期偿还的问题已经得到了解决，没有留下未了结的经济纠纷或债务。
2. 非违法行为：长期逾期无力偿还通常属于民事纠纷范畴，而非刑事或行政违法行为。因此，它本身不会构成政审的负面因素。

三. 对配偶政审的影响

1. 无直接关联：配偶的政审主要考察的是配偶本人的情况，与另一方的经济状况无直接关联。
2. 特殊情况：除非存在特殊情况，如配偶因经济问题被追究刑事责任，或双方存在共同的经济犯罪等，否则逾期偿还的问题不会影响到配偶的政审。

综上所述，长期逾期无力偿还但后来已还清，通常不会对配偶的政审产生负面影响。我的观点是，只要配偶本人在政治、道德、遵纪守法等方面没有问题，那么其政审应该能够顺利通过。如有进一步需要，您可以继续咨询我。