企业垄断行为由市场监管局处罚。具体分析如下：

一. 执法主体

1. 市场监管局：根据《反垄断法》第十条，国务院规定的承担反垄断执法职责的机构（即市场监管局）负责反垄断执法工作。这意味着市场监管局是负责查处垄断行为的主要执法机构。

2. 发改委：虽然发改委在宏观经济管理和价格监管方面发挥重要作用，但它并不是反垄断执法的主要机构。发改委的职责更多集中在价格政策、经济体制改革等方面，而非直接查处垄断行为。

二. 法律依据

• 《反垄断法》第四十六条明确规定，经营者违反本法规定，达成并实施垄断协议的，或滥用市场支配地位的，或实施具有或者可能具有排除、限制竞争效果的经营者集中的，由反垄断执法机构责令停止违法行为，没收违法所得，并处上一年度销售额百分之一以上百分之十以下的罚款。这里的“反垄断执法机构”指的就是市场监管局。

三. 实例说明

• 例如，某企业因垄断行为被查处，那么负责对该企业进行处罚的将是市场监管局，而不是发改委。市场监管局将依据《反垄断法》的相关规定，对企业的垄断行为进行调查、取证，并依法作出处罚决定。

综上所述，企业垄断行为应由市场监管局进行处罚。发改委虽然在经济管理中扮演重要角色，但并非反垄断执法的主要机构。如有进一步需要，您可以继续咨询我。