关于“理事长与校长签定协议是否有效”的问题，我们可以从以下几个方面进行分析：

首先，明确结论：理事长与校长之间签定的协议，在符合相关法律法规的前提下，是有效的。

接下来，我们详细分析：

1. 协议主体的合法性：

   • 理事长和校长作为两个具有完全民事行为能力的自然人或法人代表（视其具体身份而定），他们有权签定协议。
   • 只要他们签定协议的行为不违反法律、行政法规的强制性规定，且不违背公序良俗，那么该协议就具备合法性。

2. 协议内容的合法性：

   • 协议内容应明确、具体，涉及双方的权利和义务。
   • 协议内容不得违反法律、行政法规的强制性规定，如不得涉及非法活动、不得损害国家、集体或第三人的合法权益等。

3. 协议形式的合法性：

   • 一般情况下，协议可以采用书面形式或口头形式。但对于某些特定类型的协议（如涉及大额资金、重要权益等），法律可能要求必须采用书面形式。
   • 书面协议应明确记载双方当事人的名称、标的、数量、质量、价款或报酬、履行期限、地点和方式、违约责任、解决争议的方法等条款。

4. 协议的生效要件：

   • 协议双方应具有签定协议的合意，即双方均自愿接受协议条款的约束。
   • 协议应经过双方签字或盖章确认，以表明双方对协议内容的认可。

5. 特殊情况下的协议效力：

   • 如果理事长或校长在签定协议时存在欺诈、胁迫等情形，可能导致协议无效或可撤销。
   • 如果协议内容显失公平，也可能导致协议被认定为可撤销。

综上所述，理事长与校长之间签定的协议，在符合上述合法性要求的前提下，是有效的。当然，具体协议的效力还需根据协议的具体内容、签定过程以及相关法律法规进行综合判断。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。