网商贷协商还款后，原网商贷借款账户的钱会在还清借款后由系统自动清零，不需要用户手动操作。具体分析如下：

一. 网商贷协商还款的本质

• 网商贷协商还款是借款人与贷款人之间就借款的偿还方式、时间等达成的协议。根据《中华人民共和国民法典》第六百六十七条，借款合同是借款人向贷款人借款，到期返还借款并支付利息的合同。协商还款只是对这一合同内容的部分调整，不影响合同的基本性质。

二. 还款后账户的处理

• 在协商还款并实际履行后，借款人按照约定的方式（如对公账户）进行还款。一旦借款全部还清，原网商贷借款账户中的余额（即借款金额）会由贷款机构的系统自动进行清零处理。这是贷款机构内部账户管理的常规流程，无需借款人额外操作。

三. 对公账户还款的说明

• 对公账户还款是协商还款中可能的一种还款方式，指的是借款人将还款金额转入贷款机构指定的对公账户。这种方式并不影响借款账户余额的清零处理，只是还款路径的一种选择。

综上所述，网商贷协商还款后，原网商贷借款账户的钱会在还清借款后由系统自动清零。这是贷款机构内部账户管理的常规流程，无需担心账户余额的问题。如有进一步需要，您可以继续咨询我。